Sanogo sinh trong gia đình sáu con của vợ chồng ông Mamadou Sanogo và vợ [5] Amadou Sanogo và được người thân gọi bằng biệt danh là "Bolly".

Sanogo đến từ Ségou, một trong những thành phố lớn nhất của Mali bên sông Niger.[6] Sanogo đã phục vụ 22 năm trong quân đội.[7] Trước cuộc đảo chính, Sanogo đã giữ một vị trí quân đội cấp trung.[8] Một người tham gia chương trình Giáo dục và Huấn luyện Quân sự Quốc tế,[9] ông được đào tạo "tại các chương trình huấn luyện ở Hoa Kỳ, ở Georgia và tại căn cứ của Thủy quân lục chiến ở Quantico, Virginia",[10] nhưng các giảng viên người Mỹ của anh "không bao giờ đánh dấu anh ấy là tài liệu lãnh đạo trong tương lai ". Ông cũng học tiếng Anh tại căn cứ không quân Lackland ở Texas.